はい、もちろん発行していただけますのでご安心ください。
しかし、こちらからご紹介の解体業者さんでない場合、発行できない業者もあるようですのでご注意下さい。
その後必要な建物滅失登記は業者がアドバイスをしてくれます。

【解体業界ウラ話】

「うちは下請け仕事で解体をずっとやっているんだけど、取り壊し証明書ってなんですか？書き方を教えてもらえますか？」
驚くことに、解体業者さんからいまだにこのようなお問合せを頂くことがあります。
（※もちろん、解体サポートの提携業者さんではありませんが。）